Virallisena rotuna espanjanvesikoira on nuori ja sen terveydestä ei vielä tiedetä kovin paljon. Yleisesti ottaen rotua pidetään keskimäärin terveempänä kuin monia perinteisiä ja pitkään linjattuja rotuja.
Viimevuosina on Pohjoismaissa (erityisesti Suomessa ja Ruotsissa, joissa kanta on suurempi), Iso-Britanniassa, monissa Keski-Euroopan maissa sekä USA:ssa on koirien terveystutkimuksille annettu entistä suurempaa painoarvoa. Rodun kotimaassa tutkimuksiin suhtaudutaan edelleenkin pääosin kevyesti ja hieman vastustellen.
Yleisimmäksi terveysongelmaksi espanjanvesikoirilla on havaittu lonkkadysplasia. Röntgenkuvien perusteella arvioitavia dysplasia-asteita C-D on kohtalaisen paljon tutkitusta kannasta. Jotkut dysplaattisiksi arvioidut lonkat oireilevat selvästi jo nuorena, kun taas toiset koirat voivat ovat kliinisesti terveitä vanhemmaksikin. Lonkkamaljan ja -nastan epäsopivuuden laatu ja koiran muut ominaisuudet sekä ympäristöolosuhteet ratkaisevat oireilun tason. Nuorien espanjanvesikoirien liikunnan ja ruokinnan laadussa on oltava huolellinen, jottei ainakaan pahenneta mahdollista perinnöllistä vikaa tahallaan. Samoin hyppyjä ja korkeita estesuorituksia on syytä pitää aisoissa aina vuoden ikään asti. Myös hihnassa kiskominen aiheuttaa kohtuutonta rasitusta nuoren koiran pehmeille nivelille. Pentua valitessa on syytä ottaa huomioon vanhempien lonkkatutkimustulokset, mutta on hyvä pitää mielessä myös se, etteivät terveetkään vanhemmat aina tuota välttämättä vain terveitä pentuja ja ettei koiranjalostus saa olla pelkkien lonkkien jalostamista. Joskaan asiaa ei sovi myöskään vähätellä.
Seuraavia sairauksia on myös todettu espanjanvesikoirilla yksittäisiä tapauksia: allergia, purentavika, hammas- ja kivespuutokset, häntämutka, varvasanomalia, kilpirauhasen vajaatoiminta, SA-ihosairaus, haittaava lonkkaniveldysplasia sekä PRA, HC ja R PHTVL/PHPV -silmäsairaudet.
Suomen kennelliiton » jalostustietokannasta saa tietoa espanjanvesikoirien terveystutkimusten tuloksista selkeästi pentueittain, suvuittain, yksilöittäin ja kasvattajien mukaan.